開業後の長崎新幹線は、どのような運航形態になるにせよ基本時間あたり2本なので、佐世保特急を武雄温泉で乗り換えにすると博多-佐賀の本数が今の2ないし3本から減る。
よって、開業後も佐世保特急は博多直通で維持される。